Тогда возникает вопрос, Почему?....

6. Выходные конденсаторы при снятой крышке БП греются до 50-55 градусов, это нормально?

С нагревом выходных буду разбираться, т.к. греются во всех цепях, +5, +12 и +3.3 В - какая-то загадка.

После добавления в параллель всем выходным конденсаторам керамики 0.22 мкФ нагрев электролитов уменьшился с 55 до 45 градусов (измерения проводились со снятой крышкой блока, т.е. фактически при отсутствии принудительного охлаждения).

1. Пульсации не изменились, 20 и 40 мВ по +5 и +12. Амплитуду определяют по-прежнему короткие выбросы, керамики 0.22 мкФ недостаточно, чтобы их погасить.