сгоревшая сборка - это не причина

сгоревшая сборка - это  не причина перекоса в данном случае! 
а вот то, что со сборками поколдовали ( поменяли ) вот это и есть основная причина того, что перекос уменьшился.
у разных сборок разное прямое напряжение на диодах , тем более , что одна из них высоковольтная а другая низковольтная.

интересно всё-таки узнать как бы изменились напряжения на другой конфиге ( типа Pentium Prescott 3,0 GHz )
В моей практике на такой конфиге перекос всегда в другую сторону:
по 5в имеем 5,25в ,а по 12в иммем 11,7в.
Для наглядности приведу несколько  цифр:
так как процессор потребляет от 60 до 100 (средн. 80) ватт, 
то перенос такого потребителя с канала 12в на канал 5в означает
 уменшение тока в канале 12в на 80/12=6,7А
и увеличения тока в канале 5в на 80/5=16А