Ирсофт может не с первого раза коннектиться,

Ирсофт может не с первого раза коннектиться, это нормально. Пробуйте на 19200. Вы подробнее опишите как записывали и что было в ирсофте и на ЖК атмеги при этом. И еще, Вы случайно землю между компом и атмегой соединить не забыли?

Самодельная ИК паяльная станция (часть 5)