Длительность - возьмите скажем 1 мс от 5В

Длительность - возьмите скажем 1 мс от 5В (чего 1 мс - из примерно следующих соображений: т.к. длительность импульсов амплитудой 300В на первичке в норме где-то в районе 20-30 мкс; скорость нарастания тока обратно пропорциональна напряжению; следовательно - для 5В ток вырастет до некоего значения, при котором сердечник еще не в насыщении, где-то за 1 мс); пауза - 10-20мс.
Единственное замечание - ключ должен быть относительно высоковольтным (BC640 к примеру взять, ну или что-то подручное из первичек БП).

COOLER MASTER RS-430-PMSP, канал 12В не держит нагрузку