Да потому, что проблема как-то размыто выглядит, особенно

Да потому, что проблема как-то размыто выглядит, особенно по часам RTC.
1. В диспетчере задач процент загрузки процессора лихорадит от нуля до 100%.
Посмотреть, какой процесс так грузит систему ведь можете?
2. Попробовать установить другую систему, ту же XP, как сами написали, вполне можно, только не зверьков разных, а чистую. Ну и попробовать загрузить различные LIVE_CD_DVD_USB, чтоб посмотреть на поведение платы.