Еще проверьте качество контактов в разъеме доп. питания

Еще проверьте качество контактов в разъеме доп. питания PCI-Ex, могли подгореть.
А так Вы не огласили, что за БП, какие видеокарты сгорели (и по возможности, что в них сгорело). Думаю, Вам бы дали более развернутые советы. А так - одно гадание.