По-поводу второй LM339 расположенной на отдельной плате -

По-поводу второй LM339 расположенной на отдельной плате - мне попадались такие.
Судя по всему, контролируют ток потребляемый по каналу +12в и могут вырубать БП.
Вполне могут быть причиной выключения БП в вашем случае.

Цитата:
Кстати при этом состоянии все напряжения кроме +5VSB отсутствуют и компьютер можно включить тока после отключения блок(если подождать пару секунд до разряда емкостей).

это 100% признак срабатывания защиты , остаётся разобраться какой.
Если бы пропадал павер_гуд , то компьютер бы просто перезапускался, как при нажатии на кнопку ресет.

colorsit 400PTK самопроизвольно выключается