Угу, смотрит :). Вот только чему

Угу, смотрит. Вот только чему соответствует свечение светодиода под названием "Reset" - лог.1 или лог.0? Оба варианта равновероятны. Поэтому я и интересуюсь реальным значением сигнала PCI_RST#, а не состоянием светодиода.

IMHO СМ, ЮМ, процессор. ЮМ и процессор - не напрямую, а через линейные стабилизаторы, но наличие промежуточных линейных стабилизаторов не влияет не величину нагрузки.
Кстати, нагрев транзисторов может быть обусловлен не только большой нагрузкой, но и проблемами в системе управления. Bootstrap'ный конденсатор снесли, например. Или резистор в bootstrap'ной цепи (если он штатно есть) увеличил свое сопротивление. И т.д.

Вы бы измерили еще раз выходные напряжения всех стабилизаторов на матплате и привели на картинке или текстом.