Перекос напряжений при подобной доработке связан обычно не

Перекос напряжений при подобной доработке связан обычно не с трансформатором, а с диодами. Поэтому первым делом надо посмотреть какая диодная сборка стоит по выходу +12В. Если стоит 2 дискретных диода, припаянных к железке.
Это FR302 - 2 3х амперных быстрых диода, может отдавать макс. 4,5А. Надо выпаять это изделие и поставить сборку диодов Шоттки, высоковольтную, не ниже 100В (диоды шоттки, взятые из канала 5В бп АТХ не годятся, они 40-45В!), надо наподобие MBR20100CT, 20В, 100А. Можно поставить сборку быстрых диодов, например BYW51. Еще неплохой вариант - советские диоды КД213 (они 10А, 2 шт полумостом 15А - вполне достаточно). Они тоже замечательно работают, правда их сложно крепить к радиатору. Внешне похожие на них и более мощные советские КД2999-2997 (20 и 30 А) использовать нежелательно: у них более высокое падение напряжения, что увеличивает перекос каналов +5/+12В.


Сам же разъем P4 можно изготовить из ненужного 20-пинового коннектора от БП АТХ. Паять провода лучше непосредственно на плату БП. Переделанный таким образом БП Codegen 250W, запросто питал системный блок i865+Cel D 2.8 GHz+HDD 40Gb+DVD_ROM.
Можно как уже советовали - вытащить 12В провод из коннектора 3.5" FDD и использовать его.