теоретически можно, Но я совершенно не представляю, как вы

теоретически можно,
Но я совершенно не представляю, как вы будете это синхронизирвать с программой копирования.
Если делать например под Win в ручную,
За 6 секунд помноженных на 3 попытки, которые отводит Win на ожидания, прежде чем отключить устройство
Вам нужно успеть зайти в терминал, по Ctrl+Z
перейти на 1 уровень,

ввести команду,
время остановки двигателя около 6 секунд,
минимальное время ожидания команды е после останова - 5 секунд,
время раскрутки и выхода в готовность около 8 секунд.
и того более 20 секунд. если за пару секунд успеете вести все команды и не ошибиться.

Под линуксом возможно можно как-то все это организовать программно, отслеживая моменты ошибки и приостанавливая программу копирования,
Но помните, что на физически поврежденом месте головки могут окончательно запилиться.
И вычитывать нужно в первую очередь несбойные места. а плохие места быстренько перепрыгивать.
И только в конце вычитывания, заняться уже сбойными местами.
А для этого процесса потребуется создавать карту вычитанных и невычитанных секторов, чтобы много раз не мурыжить одни и те же поврежденные места.
Вообщем где-то на полгода себя работой обеспечите, пока все вычитаете.