Во-первых, не 100x6.3, а 1000x6.3. Во-вторых, пульсации всегда

Во-первых, не 100x6.3, а 1000x6.3. Во-вторых, пульсации всегда есть - вопрос в том, видно их или нет, и значительна их амплитуда или нет.

Далее, надо найти распиновку AGP и проверить все напряжения и вообще все, что можно проверить. Затем поискать оборваные дорожки и сколотые элементы.

Много раз видел, как платы не видят одни видеокарты и стопорятся на 25 коде с другими, при этом видеокарты рабочие.

GA-8SR533P не видит AGP с PCI работает