А кто сказал, что нужна? Что было,

Цитата:
Оказывается зачем-то там нужна AT29C010A

А кто сказал, что нужна? Что было, то и поставили, нормальная практика. A16 у флешки подключен (по плате)?

И что, если шить штатной утилитой? Она же есть в комплекте.

Цитата:
Впаял отсутствующюю перемычку на линию A15

Да, и отследите A15 от флешки до чипа. Похоже, для флешки он четко стоит в "1", независимо от того, что там думает/выставляет чип.
Возможно, не надо было ничего впаивать и просто замены флешки вполне достаточно.