Вентиляторы можно и оставить, просто переключить на 5

Вентиляторы можно и оставить, просто переключить на 5 В. Так они вообще не слышны.

Или, как вариант, можно поставить вентиляторы с термоконтролем скорости и воткнуть их термодатчик в нужное место. Так они будут еле-еле крутиться в штатном режиме, а в случае 40-градусной летней жары не дадут железу перегреться и включатся на необходимую для поддержания рабочей температуры скорость.

В блоке питания особенно актуально, ибо они без вентиляции дохнут, особенно АТшные (у них защиты от перегрева обычно нет вообще).

Винчестерам также рекомендуется сделать небольшое принудительное охлаждение.

Я в свое время тоже решал подобную проблему, но не столько из-за электричества, сколько из-за жары в комнате, создаваемой круглосуточно работающим моим рабочим компом. Нужно было что-нить маложручее и малогреющееся. Этим оказался Селерон-533, тоже на 66 мгц, с 192 метрами памяти и какой-то первобытной видяхой от S3.
Сетевухи обычно почти не греются - значит почти не потребляют энергии (1-2 вт не в счёт).
Память РС-133 тож не греется.
Процессор - рекомендую поискать Via Cyrix3 (800Mhz/133/512) - по скорости как пентиум-3 800 мгц, а греется втрое меньше любого селерона. Хотя это чудо поддерживается не всеми материнками, работает только на 810/515 чипсете, и то требует перешивки биоса в половине случаев.

Впрочем, если бы я решал эту проблему сейчас, а не 3 года назад - я бы пошел купил какую-нить мини-ITX плату с процессором типа Intel Atom, засунул бы её в компактный мини-ITX корпус, поставил бы туда винчестер на пару терабайт и получилась бы классная компактная и экономичная качалка. Цена вопроса порядка $150 + винч.