IMHO надо разнести HDD и CD на разные

IMHO надо разнести HDD и CD на разные шлейфы либо, если это не поможет, вообще не в железе дело, хотя Барракуда на ultra ata 33, который на всех интеловских чипсетах с 430TX до 440 Bx/ZX один и тот же работает заметно медленнее, чем например IBM/Hitachi. Тогда разбирайтесь с запущеными программами, такое может быть, например, следствием активности антивируса.