Да не заливаете Вы прочитанную прошивку, она просто

Да не заливаете Вы прочитанную прошивку, она просто остаётся, Ваш программатор не может стереть эту МС и записать тоже, т.к. еслиб мог писать - то родная прошивка былаб испорчена однозначно, т.к. при прошивке можно только изменить 0 на 1.
И те 5% - сравните родную с той что шьёте, явно совпадают до этого места.

Микросхемы Flash BIOS