А вы сравните BootBlock от обоих - большинство

А вы сравните BootBlock от обоих - большинство PCI регистров там. И проверьте из-под Windows с помощью WPRCE или RW Everything какие регистры в каком состоянии у Вас со старой и с новой версией BIOS. Для эксперимента я думаю многие можно пробовать менять на лету.