Я имел в виду все доступные флешеры: awdflash,

Я имел в виду все доступные флешеры: awdflash, amiflash, uniflash, runiflash.
MD5 в данном случае не используется, просто в файловом менеджере сравниваете содержимое двух файлов - прошивки и того, что вы считали из микросхемы после перешивки.