Есть большое подозрение, что виновата не msmouse.vxd, а

Есть большое подозрение, что виновата не msmouse.vxd, а то, что пытается грузиться СРАЗУ ПОСЛЕ. Наверное, будет полезно срисовать полный лог загрузки Вин98 на нормально работающей машинке... и помыслить на эту тему.

А восстановить Винду "повторной установкой" - не пробовали ? На 98-й это обычно достаточно безболезненно... даже прямо с загрузочного диска - правда, в Вашем варианте стоило бы поначалу сбэкапить имеющуюся (хотя бы содержимое реестра), благо и это 98-я спокойно позволяет делать. В крайнем случае - всегда будет возможность загрузиться в Голый ДОС и с помощью Волков или Нортон Коммандера "все вернуть как было".

K6-2 и сокет 7 проблема