Т.е. перед включением в дисководе находится системная

Т.е. перед включением в дисководе находится системная дискета, затем производится включение, опрос дисковода и выдача надписи?
На мой взгляд bootblock не воспринимает вашу дискету как системную.
Возможно данный дисковод не может прочесть дискету, созданную на другой машине. Попробуйте создавать системную дискету и загружаться с нее на одном и том же дисководе. Предварительно проверьте загрузку с этой дискеты на другой машине на этом же дисководе (на случай глючности дискеты).
Если это не поможет, то можно воспользоваться hotswap'ом или программатором.