Кстати если просто подключить CPU FAN

> Кстати если просто подключить CPU FAN к разъему System FAN?
Вариант номер раз.
В BIOS Setup поставить Ignore, а в ОС следить за вентилятором любой "мониторилкой" (начиная от "родной" PC-Probe) - вариант номер 2.

Не надо усложнять себе жизнь... Оно того не стОит...