Понимаю, что версия о питании не самая вероятная,

Понимаю, что версия о питании не самая вероятная, но лучше начать с ее проверки,
так как поставить заведомо исправный блок питания для проверки проще, чем заменить южный мост.
Работа в дос не опровергает версию о питании, может по разному работать программное обеспечение:


при работе в дос используется SMM-драйвер входящий в состав BIOS, при работе в Windows - драйвера Windows.
может так получиться, что в дос при ошибке в режиме USB 2 драйвер переключается в режим USB 1
(поэтому работает), а Windows ту же ошибку обрабатывает по-другому, без попытки переключиться в режим
USB 1 (поэтому не работает).
Да, маловероятный сценарий, но до замены моста его нужно проверить.
Ну и разумеется кабели, качество разъемов, драйвера Windows тоже могут быть причиной.