Подробнее: если снимаете ШИМ контроллер (любой), то перед

Подробнее: если снимаете ШИМ контроллер (любой), то перед тем, как включить (ну вот надо, и всё):
снять транзисторы, которыми он управляет (минимум - верхнее плечо, на которое приходит плюс питания) или посадить затворы всех транзисторов в данном преобразователе на землю.
Иначе транзистор с "висячем в воздухе" затвором вполне откроется самостоятельно и все входное напряжение пойдет во вторичную цепь.