Ну, с точки зрения ремонтника проще снять флешку

Ну, с точки зрения ремонтника проще снять флешку и зашить программатором...
А Вам - я бы "коротил" флешку при старте (как - зависит от флешки, задача - обломать сетевой чип по чтению Addon-ROM из флешки).
Да, Вы бы хоть модель сетевой карты рассказали. Здесь людей, видевших(!) ВНЕШНЮЮ PCI-E сетевуху человека 2-3, имеющих хоть какую - хорошо, если 1. А шивших там через PCI флешку - ни одного.

Материнки есть, но вряд ли у Вас под рукой найдется что-то. Это бренды - типа "взрослые" SuperMicro, HP, Intel и т.п.