- преремотать можно, сердечник не должен быть

Цитата:
Можно ли намотать ДГС?

- преремотать можно, сердечник не должен быть ранее перегрет.
- необходимо учитывать направление намотки катушек.
Если позволяют габариты - взять провод потолще
Цитата:
Или причина гораздо глубже?

Естественно проверить и "простую" электронику. Надеюсь у Вас есть чем правильно проверить испарвность p-n переходов. Проверьте сборку диодов Шотки в канале +5V.