Вот и я думаю - с

Вот и я думаю - с чего бы это про Win вспоминать .

Желательно использовать флешер, штатный для той платы, на которой производится hotswap, но никто не запрещает пользоваться другими флешерами. Просто вероятность того, что чужой флешер достучится до флешки немного меньше, чем у штатного флешера (универсальные флешеры аля uniflash'а могут иметь одинаковые шансы относительно штатного флешера).
А с учетом ключей можно заливать практически все, что угодно.