Скорее всего стабилизатор на данных транзисторах формирует одно

Скорее всего стабилизатор на данных транзисторах формирует одно из питаний той части ЮМ, которая отвечает за интерфейс PCI-E. Но сам слот PCI-E от этого стабилизатора не запитывается.
P.S. Но техническое решение Gigabyte для данной платы rev.1.0 IMHO уж больно извращенное.

Gigabyte, GA-m55S-S3, PCI-eX замена мосфетов