Совпадение КС не дает 100% гарантии целостности прошивки.

Совпадение КС не дает 100% гарантии целостности прошивки. А вот побайтовое совпадение это гарантирует.
Можно поискать причину проблем в аппаратной части - глюки элементов, глюки по питанию и т.д.
Можете на всякий случай дать ссылку на считанную прошивку из флешки.