У некоторых винтов есть/бывает некая несовместимость друг с

У некоторых винтов есть/бывает некая несовместимость друг с другом. Например у Maxtor-ов такое точно было. Попробуйте скомбинировать винты по каналам - например 80 и 40, 160 и ДВД; 80 и ДВД, 40 и 160 и так далее. В какой-то комбинации заработает.
Копирование в пределах одного раздела это ни в коем случае не показетель, потому что здесь не происходит физического копирования файлов. Просто переписываются таблицы размещения файлов, а это считанные байты..

Gigabyte GA-8IPE1000G (rev: 4.03) и копир-перемещ. файлов