качаем datasheet на микросхему flash-памяти и внимательно его читаем

Это не обязательно нога микросхкмы БИОС, возможно это чипсет. Что за система у Вас, alxdef?

Asus P5LD2 SE

Возможно, в теории это выглядит так: откусываются нога, отвечающая за запись бутблока и нога, отвечающая за запись остальной памяти, затем соединяются перемычкой на землю.

Для начала теория состоит в прочтении документации :) (видел на P5LD2 SE микросхему от SST, по поводу окончания не помню - A или B, но в документации сказано аналогично):

The Top Boot Lock (TBL#) and Write Protect (WP#) pins are provided for hardware write protection of device memory in the SST49LF00xA. The TBL# pin is used to write protect 16 boot sectors (64 KByte) at the highest flash memory address range for the SST49LF003A/004A/008A and 4 boot sectors (16 KByte) for SST49LF002A. WP# pin write protects the remaining sectors in the flash memory. An active low signal at the TBL# pin prevents Program and Erase operations of the top boot sectors. When TBL# pin is held high, write protection of the top boot sectors is then
determined by the Boot Block Locking register. The WP# pin serves the same function for the remaining sectors of the device memory. The TBL# and WP# pins write protection functions operate independently of one another.

IMHO было бы логично защищать bootblock, а остальную часть не защищать от записи.

Если бы было всё так легко и просто, то не было бы проблем :)
Однако эти выводы учавствуют ещё и в куче различных команд/операций, поэтому просто замкнуть их на землю - это не верно.