Основной момент - наверняка отсутствует 3.3V на PCI

Основной момент - наверняка отсутствует 3.3V на PCI у этой платы.
Те контроллер должен обходиться без 3.3V PCI(иметь свой стабилизатор).

Широко распространенные дешевые контроллеры Sil680(PATA) и Sil3112(SATA) имеют свой стабилизатор 3.3V
(по крайней мере те что мне попадались), но там другая проблема: RAID BIOS останавливается при определении
диска, это проявляется на всех материнках с Award 4.5(с AMI нормально работает; с Award6.0 работает, но со
странностями). Исправить можно прошив non-RAID version.

С Promise PATA вплоть до U133TX2 скорее всего будет нормально. Adaptec 1210SA (SATA) скорее всего тоже.

Ну короче когда будет известна конкретная модель, что Вы предполагаете ставить, можно обсудить.