Осциллограф - не частотомер, с точностью до герца

Осциллограф - не частотомер, с точностью до герца не измерите, да и не нужно. Важней - сам факт наличия генерации. (Естественно, если смотрите PCI_CLK, то должно быть 33Мгц, а не скажем 3,3Мгц).
Гладкая синусоида или не очень - может быть вызвана внешними наводками на щуп и неудачно выбранной точкой подключения "земли" прибора на плате.

Не стартует ASUS P5N72-T Premium N-Force 780i-SLI