На выходе (т.е. в точке соединения

На выходе (т.е. в точке соединения D26 и D27) будет бОльшее из двух напряжений, поступающих на D26 и D27 (с учетом падения напряжения на диодах, естественно).

Дежурка ничем обычно не защищается (если я правильно понял смысл слова "дежурка" - дежурный источник напряжения).

Стабилитроны связаны с контролем выходных напряжений, а перечень резисторов с диодом - контроль работы каскада раскачки IMHO.

Если вы организуете нормальную схему защиты по току, то скорее всего да (не вчитывался в журналы "Радио"). И еще небольшая рекомендация - IMHO стоит отойти от схемы ATX в сторону AT, т.к. дежурный источник - одна из проблемных конструкций в ATX.