Если транзистор действительно работает в линейном стабилизаторе, то

Если транзистор действительно работает в линейном стабилизаторе, то ЛЮБОЙ транзистор будет греться также! Разве что транзисторы в другой корпусировке греться будут меньше, из-за того что больше тепла рассеивают.
Кстати, как вариант, может быть вы корпус транзистора плохо припаяли? А то единственным теплоотводом таких транзисторов является сама плата.