Значит ШИМ. Можно ещё снять все транзисторы и

Значит ШИМ.
Можно ещё снять все транзисторы и проследить где начинается КЗ.
Можно удостоверится что дело только в VRM убрав колодку питания CPU. Если плата запустится, то однозначно смотреть всё вокруг проца и VRM. Отследить по дорожкам где КЗ и менять элементы пока не уберётся.