Включение и выключение платы происходит штатным образом, т.е.

Включение и выключение платы происходит штатным образом, т.е. с кнопки PW_SW?
Тогда не трогайте Вы MIO пока.
Процессор живой, поддерживаемый платой? Спецификацию, пожалуйста.
Генерация на часовом кварце есть? Да и по напряжениям маловато указали. Хотелось бы видеть по всем силовым транзисторам и стабилизаторам в TO-252, TO-223. История болезни то-же имеет значение.