Вы сначало определитесь, когда контроллер снимаете, а

Цитата:
какие МВ могут запускатся без LAN чипа , а какие нет ?

Вы сначало определитесь, когда контроллер снимаете, а когда просто интерфейс PHY? Ведь зачастую контроллер интегрирован в ЮМ и зачастую PHY ошибочно обзывают контроллером.
Если логически порассуждать, контроллер в ЮМ исправен и сканирование PCI нормально проходит, а в вашем случае контроллер снят, в биосе включен, шина PCI найти его не может.